В Токтогульском районе лето теплое, сухое и малооблачное, а зимой морозные, снежные и местами облачные. В течение года температура обычно колеблется от -9 °C до 30 °C и редко бывает ниже -16 °C или выше 34 °C. Лучшее время года для посещения местности с целью отдыха при теплой погоде - с середины мая до середины сентября.