Территория района протянулась с севера на юг вдоль бассейна реки Кара-Ункур и хребта Бабаш-Ата в отрогах Ферганского хребта. Хребет Бабаш-Ата (протяженностью около 100 километров, высотой до 4427 метров над уровнем моря) примыкает к Ферганскому хребту с запада.